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AGeNT

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安捷伦基因组学 NextGen 工具包 (AGeNT) 是基于 Java 的软件模块,专门处理 Agilent SureSelect 和 HaloPlex 文库测序后生成的靶向高通量测序数据的读出序列。

使用 AGeNT 模块的 Trimmer 实用程序处理读出序列,识别和去除接头序列并提取双分子条形码(对于 SureSelect XT HS2)。

使用 AGeNT 模块的 LocatIt 实用程序处理来自 HaloPlex HS、SureSelect XT HS 和 SureSelect XT HS2 Illumina 测序运行的分子条形码 (MBC) 信息,其中包含标记或合并重复的读出序列,并输出 BAM 格式的文件。
仅限研究使用。不可用于诊断目的。

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