色谱柱的选择一半是科学，一半是艺术。我们之所以这么说，是因为这里有一些确定的明了标准：与应用相适合的色谱柱固定相、与系统压力限相适应的规格等等。

对于液相色谱柱的选择，我们首先要根据化合物的类型、溶解度确定液相方法的模式,如图一所示。

反相色谱是到目前为止最通用的 HPLC 方法，大约占所有方法的 60%，将近 95% 的色谱工作者都在使用，这里我们主要来讨论反相色谱柱的选择。

从化合物的极性考虑（见下图），对于较强极性的化合物，一般会使用较高比例的水相作为流动相，推荐首先尝试耐高水相比例流动相的 Stable Bond 系列，比如 SB-C8 或 SB-Aq，如果SB系列不能得到好的分离结果，可以尝试同样耐高水相比例流动相并提供选择差异性较大的 Bonus RP 色谱柱。或者，可以选择极性较强的氰基柱或苯基柱。另外，如果反相色谱柱对强极性化合物保留太弱，则可采用亲水色谱模式，比如 Agilent ZORBAX HILIC Plus 色谱柱。对于中等极性到非极性的化合物，可以从C18固定相开始，比如 Agilent ZORBAX Eclipse Plus C18，如果保留太强，则可以选择极性稍强的 C8 或苯基柱。如果反相模式保留弱，或选择性差，同样也可以尝试 HILIC 模式，或极性较强的氰基柱。

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从化合物结构上考虑，首先根据化合物的大小选择不同孔径的色谱柱。 一般分子量大于 2000 或者空间位阻较大的分子，建议使用孔径较大的色谱柱（比如 300Å ）；分子量小于 2000 的小分子化合物，建议采用较小孔径（80 Å 到 120 Å）的色谱柱。一般情况下，我们采用 Agilent ZORBAX Eclipse Plus C18 作为方法的首选柱。如果不能提供较强保留，则对于酸性的目标化合物，可以采用较低的 pH 流动相增强保留，可选择耐低 pH 值流动相的 SB-C18/C8 色谱柱；对于碱性的目标化合物，可采用较高pH的流动相增强其保留，则可以选择耐高 pH 值流动相的 ZORBAX Extend C18 或 Poroshell HPH-C18/C8，对于一些含芳香环、卤代物或位置异构体的化合物，可以尝试苯基柱或五氟苯基柱，比如 Poroshell 120 PFP 或 Poroshell 120 Phenyl Hexyl.

从流动相的 pH 上考虑，一般情况首选 Agilent ZORBAX Eclipse Plus C18 或 Poroshell EC-C18. 如果流动相的 pH 值低于 3，则可以选择耐低 pH 值流动相的 SB 系列的色谱柱，比如 ZORBAX SB-C18 或 Poroshell SB-C18. 如果流动相的 pH 值高于 7，则可以选择耐高 pH 值流动相的 Extend 或 HPH 系列的色谱柱，比如 ZORBAX Extend-C18, 或 Poroshell HPH-C18/C8. 如果流动相水相比例较高，比如高于 90% 的水相等度洗脱，则首先选择耐高水相比例的色谱柱 SB-Aq 系列,或提供不同选择性的 Bonus RP 及 Polaris 系列。

样品应用：在下面表格中，我们列出了常用的 Zorbax 系列反相色谱柱的特点和样品应用。